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单位发放职工工资薪金时，会从应付工资中扣除很多内容，比如个人应承担的“三险一金”、个人奖惩兑现、水电费等。在计算个人所得税时，是否从工资薪金收入中扣除？
一、扣发的“三险一金”。应付职工薪酬包含了员工个人承担的社保费用，因为员工个人承担的社保费用是从工资中扣除的，是薪酬的一部分，只是不是直接付给员工，而是代扣后付给社保机构。居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等。“三险一金”是作为个人所得税单独扣除项，因此，应当以扣除“三险一金”前的收入为工资薪金收入。
二、扣罚的工资。 《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第六条第一款规定：工资、薪金所得，是指个人因任职或者受雇取得的工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或者受雇有关的其他所得。即个人所得税的计税依据是“个人所得”。 一个单位的考勤管理制度，其实也是一个单位薪酬制度的重要组成部分。员工因为迟到或早退被扣款，实际上就是减少了对该员工的薪酬支付，也就是减少了员工的“个人所得”，个人实际取得的工资薪金才须计入个人所得税应纳税所得额，因请假、迟到、工作失误被扣发的工资，个人并未实际取得。因此，这部分扣发的工资不需计入个人所得税应纳税所得额，同样道理，有些单位对于员工出勤有奖励，有所谓的“全勤奖”。对于“全勤奖”，其实也是薪酬的一部分，也是需要并入工资薪金中去一并计算个人所得税。
三、扣发的个人消费。公司发放工资时，从工资中扣发的属于个人消费的水电费等，因为基本减除费用，即个税起征点，是最为基础的一项生计扣除，考虑了个人基本生活支出情况，设置定额的扣除标准。因此，从工资中扣发个人消费的费用不能从工资薪金所得中扣除。
